無論選擇代理注冊公司還是自己注冊公司都有其優缺點，需要根據不同的情況進行分析。下面就深圳公司注冊中代理和自己注冊的優缺點進行細分分類：

1. 注冊費用：一般來說，用代理注冊公司的服務費用相對于自己注冊會更高一些。因為代理注冊公司通常提供完整的服務和專業的顧問，也對公司注冊程序有足夠的經驗和知識，能夠讓注冊更加順利。但是，對于預算緊張的企業來說，可能會選擇自己辦理以節約開支。
2. 代理的專業性：代理注冊公司在深圳公司注冊時通常具有豐富的經驗和知識，尤其是對相關政策和法規的了解更加全面，這可以確保注冊程序完整而準確。而自己辦理公司注冊可能更容易出現錯誤，導致注冊流程緩慢，總體注冊過程也可能被耽誤。

3. 時間：如果企業負責人和員工沒有大量空閑時間來準備注冊材料或處理政府文件，代理公司可能更適合。對于那些沒有足夠時間自己辦理注冊的企業，代理公司可以更快地完成注冊，并且幫助企業獲得所需的注冊證件。

4. 地理位置：如果企業坐落在深圳城外，那么代理注冊公司可能更有優勢。代理注冊公司通常具有總部和分支機構，可以為那些位于城市之外的企業提供更方便的注冊服務。

總之，在深圳公司注冊時，選擇代理注冊公司或自己注冊，需要根據不同情況進行分析。如果企業擁有足夠的時間、工作人員和經驗背景，自己注冊可能是更便宜的方式，并且能夠自行控制注冊過程。但如果企業無法抽出充分的時間去研究注冊程序，或對于政策和法規知識有限，那么選擇代理注冊公司就顯得更為明智。